Ultraäänihomogenisaattoreita (sonikaattoreita) käytetään mm. hyytelön tai nestemäisen näytteen rikkomiseen pienempiin osasiin tai eri nestefaasien sekoittamiseen keskenään (homogenisointi).
Ne soveltuvat mm. tuotteiden emulgointiin, homogenisointiin, näytteen esikäsittelyyn (myös partikkelikoon analyysit), jätevesianalyyseihin sekä bakteerien, virusten ja erilaisten solujen hajottamiseen.